Порядок действий по миграции между версиями:

1. Выключить и полностью очистить кэш.
2. Выключить компиляцию.
3. Сделать бэкап базы данных.
4. Удалить или переименовать файл app\etc\modules\Rugento_Exchange1c.xml чтобы отключить предыдущую версию.
5. Распаковать архив модуля 4 версии в корень сайта.
6. Получить в поддержке http://support.rugento.ru лицензию для нового модуля.
7. Настроить модуль, прописать лицензию, настроить цены и тд.
8. Изменить адрес обмена в 1С на ваш_сайт.ru/cml2
9. Произвести начальную настройку модуля.
10. Проверить выгрузку.
11. Включить кэш (если был включен до начала установки модуля).